Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gtf2e1Q9D0D5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gtf2e1Q9D0D5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms