Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc77Q9CZH8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms