Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZD5

Mtif3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtif3Q9CZD5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mtif3Q9CZD5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mtif3Q9CZD5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms