Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nsfl1cQ9CZ44 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nsfl1cQ9CZ44 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nsfl1cQ9CZ44 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms