Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim13Q9CYB0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms