Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms