Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx7Q9CY18 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx7Q9CY18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms