Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpl11Q9CXW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl11Q9CXW4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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