Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmd8Q9CX56 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms