Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms