Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pin4Q9CWW6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pin4Q9CWW6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms