Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddx28Q9CWT6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms