Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cnot11Q9CWN7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cnot11Q9CWN7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnot11Q9CWN7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnot11Q9CWN7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Cnot11Q9CWN7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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