Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smurf1Q9CUN6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smurf1Q9CUN6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms