Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otud1Q9CUB6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud1Q9CUB6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms