Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nkiras2Q9CR56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nkiras2Q9CR56 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms