Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CR55 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CR55 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CR55 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9CR55 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9CR55 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms