Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms