Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl28Q9CR40 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms