Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctrb1Q9CR35 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ctrb1Q9CR35 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ctrb1Q9CR35 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctrb1Q9CR35 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms