Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4931417E11RikQ9CR05 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4931417E11RikQ9CR05 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms