Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg12Q9CQY1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg12Q9CQY1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms