Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms