Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PompQ9CQT5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PompQ9CQT5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms