Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Riok2Q9CQS5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Riok2Q9CQS5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms