Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PsenenQ9CQR7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsenenQ9CQR7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms