Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl35Q9CQL6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl35Q9CQL6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl35Q9CQL6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl35Q9CQL6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mrpl35Q9CQL6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Mrpl35Q9CQL6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Mrpl35Q9CQL6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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