Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd1Q9CQK7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms