Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudt21Q9CQF3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms