Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TpbpbQ9CQC0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TpbpbQ9CQC0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 721 ms