Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700129C05RikQ9CQ77 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700129C05RikQ9CQ77 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms