Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkp2Q9CQ73 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkp2Q9CQ73 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms