Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpa3Q9CQ71 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpa3Q9CQ71 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms