Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcab2Q9CQ46 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcab2Q9CQ46 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Efcab2Q9CQ46 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Efcab2Q9CQ46 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Efcab2Q9CQ46 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Efcab2Q9CQ46 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Efcab2Q9CQ46 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms