Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
StambpQ9CQ26 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
StambpQ9CQ26 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms