Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Chmp3Q9CQ10 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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Chmp3Q9CQ10 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Chmp3Q9CQ10 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Chmp3Q9CQ10 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chmp3Q9CQ10 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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