Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cdk2ap2Q9CPY4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms