Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim12aQ99PQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim12aQ99PQ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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