Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc26a5Q99NH7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc26a5Q99NH7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc26a5Q99NH7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc26a5Q99NH7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms