Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cep41Q99NF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep41Q99NF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms