Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcgf6Q99NA9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcgf6Q99NA9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms