Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1b4Q99ME6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b4Q99ME6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms