Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca3Q99M54 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca3Q99M54 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms