Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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