Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cstf3Q99LI7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cstf3Q99LI7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms