Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Sh3bp5lQ99LH9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Sh3bp5lQ99LH9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Sh3bp5lQ99LH9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp5lQ99LH9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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