Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RtcbQ99LF4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RtcbQ99LF4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RtcbQ99LF4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms