Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pagr1aQ99L02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pagr1aQ99L02 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms