Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TriobpQ99KW3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms