Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmp1Q99KU0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms